沈陽南站地上分為三層，地下分為三層。地上三層分別為：地面廣場、站臺和候車大廳。地下三層分別為：地下14米綜合換乘站、地下20米地下停車場、地下26米地鐵站臺。其中，在地下14米處，建有換乘大廳，從這里出門后，50米可坐上出租車，步行5-10分鐘可坐上公交車，步行10分鐘或300米可坐上長途客車；在地下20米，建有地鐵10號線站臺；在地下26米處，建有地鐵4號線站臺，地鐵站臺與換乘大廳想相通，乘客步行200米可至地鐵站。